Senat Mahasiswa adalah Lembaga Eksekutif tingkat fakultas yang ada di FBE UAJY. Tugas SEMA mengakomodasi dan memfasilitasi aspirasi mahasiswa FBE UAJY, dalam bidang pengembangan minat dan bakat, penalaran, dan kesejahteraan mahasiswa. Beberapa program kerja SEMA FBE UAJY meliputi pertandingan olahraga, pengembangan minat dan bakat, bakti masyarakat, hingga hiburan seperti konser musik.